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こんにちは。産婦人科医のとみー（Twitter：@obgyntommy）といいます。   私はふだんは産婦人科の臨床に携わりつつ、画像系の機械学習の研究をしています。   研究の過程で「説明可能なAI」について学習し、"LIMEやSHAP"について使い方や実装方法などをまとめました。   以下に「説明可能なAI」について分かりやすい記事がありましたので、ご紹介させて頂きます。 説明可能なAIとは、米国のDARPAの研究が発端の概念で、モデルの予測が人間に理解可能であり、十分信 ...

こんにちは。産婦人科医のtommyです。（Twitter：@obgyntommy）   本記事では基本的なRのオブジェクトについて解説します。   対象としては全くRに触れたことのない方に向けになります。   非常に簡単な四則演算の内容になりますが、R Studioを用意して実際に手を動かしてみてください。   R Studioを手軽にセットアップするには RStudio Cloud が便利です。詳しい内容は以下を参照してください。     R ...

こんにちは。産婦人科医で人工知能を研究している、とみー（Twitter：@obgyntommy）です。   この記事では AWSにおけるcloud9 の使い方について基本から応用まで詳しく解説していきます。   プログラミング学習において最初に行うべきことは、実行する環境構築です。   環境構築の1つとして、Google Colaboratory を使用する方法もあるのですが、AWSも良質なクラウドサービスです。   AWSにおけるcloud9の環境構築と使い方につ ...

こんにちは。産婦人科医のとみー（Twitter：@obgyntommy）といいます。   私は普段は画像系の機械学習の研究をしています。   研究の過程で Semantic segmentation を学習し、"U-net"についてまとめました。   U-netはFCN(fully convolution network)の1つであり、画像のセグメンテーション（物体がどこにあるか）を推定するためのネットワークです。   この記事の対象者は機械学習の初学者〜中級者の方 ...

この記事では回帰分析の基本を理解して頂いてから、知識を確認するための練習問題（統計検定2級レベル）となります。 まずは以下の記事を読んで見て下さい。 それでは理解がまとまったところで、問題に移りましょう。   もくじ1 ① 単回帰分析の確認2 ② 重回帰分析の確認3 ③ 単回帰分析と重回帰分析の結果の比較4 まとめ ① 単回帰分析の確認 【前提】 各都道府県の直近1週間の人口10万人あたりの、ある感染症の感染者数と2回目のワクチン接種率のデータを用いて、次の単回帰モデルを推定しました。 直近1週 ...

この記事では傾向スコアマッチングについて主に解説させて頂きます。 記事を読むだけだと理解が深まりにくいかもしれませんので、傾向スコアマッチングの理解を深めるために有益な動画（京都大学大学院の授業の一部）を紹介します。   動画を見て、ある程度理解出来たところで、記事にて復習しましょう。 もくじ1 層別解析とは何か？2 層別解析のメリット｜交絡変数の影響を減らすことができる3 層別解析の注意点3.1 層ごとのデータ数は同じぐらいか？そもそもデータ数は十分か？3.2 1つの因子で層別した際の注意点【 ...

この記事では相関分析について、初心者の方向けに詳しく解説します。 ここで、まず量的データについて解説します。   枚数、身長、金額など、数値で推し測ることができ、数字の大小に意味をもつデータです。 人数、回数など、整数として表現されるデータで、一般的に連続して測ることができないデータ例）人数を数える時、1人の次は一般的に２人であり、1.00……001人とは数えない。 » データ・データセットの種類-総務省統計局より引用   ここで量的データの分析は、以下のように大きくは2つに分けること ...

この記事では以下の相関分析に続いて、同じく関係性の分析の1つである回帰分析を解説します。   「回帰」とは、一般的には「元の場所や状態に戻ること」を意味する言葉ですが、統計学では「因果関係」を意味します。 変数 $y$ に対して変数xがどのように影響を及ぼしているのかを明らかにする、つまりデータの動きを予測する分析が、回帰分析です。 相関分析では1対1の変数同士の関連しか見れませんでしたが、回帰分析では1つの変数 $y$ に対して複数の変数 $x$ がどのように影響を及ぼしているかを調べることが ...

この記事では分散分析を理解して頂いてから、練習として解くための練習問題となります。 上記の記事と以下の動画を視聴した上で、分散分析についての理解を深めていきましょう。       それでは理解がまとまったところで、問題に移りましょう。 もくじ1 ①　分散分析の基礎知識2 ② 分散分析の実践 ①　分散分析の基礎知識 【問題】以下の3つの文章について正誤判断してください。 分散分析では、全体のデータの散らばりは、条件による散らばりと偶然誤差による散らばりの和からなる。 分散分析に ...

この記事では χ2分布、母分散の区間推定、クロス集計表の適合度検定について解説させて頂きます。   実験や調査を行ってデータを集めるというと、血圧のように数値で表せる量的データをイメージされるかもしれません。   しかし、数値では表せないデータを集めることもあります。   例えば、年代ごとのコロナ感染者数を調べる場合、各感染者のデータは「20代」や「40代」となります。   例えば、2021年4月23日の東京都における年代ごとのコロナ感染者数を表にすると、以下のよう ...

調査や実験を行うとき、独立変数が2要因以上になることもあります。   この際に重要となってくるのが、「実験計画と、2つの条件群の平均値を比較する分散分析（2要因の（二元配置）分散分析）」です。   独立変数が2要因、3要因の場合は、1要因だけの場合と異なり、相乗効果のように要因が組み合わさることで見られる影響も出てきます。   また、1要因のときは各水準を無作為の順序で実験すればよかったですが、2要因以上になると、実験を行う順序もしっかり考えなければなりません。   ...

こんにちは。産婦人科医のとみー（Twitter：@obgyntommy）です。   統計とは少し話が逸れますが、医学の領域では常により良い治療法が探求されています。（もちろん、他の分野もそうです。）   新しい治療方法が本当に有効かを確認するには、従来の治療方法と新しい治療方法を比較して評価するのが、最も直感的に理解しやすいです。（※ 本当はこんな簡単なものではないのですが、カンタンに言うと、です。）   この2つの条件の比較で最も利用される統計手法が、t検定です。 &nbs ...

実験を行うとき、2つの条件群しか設定しないということは、それほど多くありません。   例えば、新しい降圧薬の効果を調べる場合には、新しい降圧薬を飲む条件と薬を飲まない条件、それからプラセボ条件の3つの条件を設けることもあります。   ここで出てくるのが、3つ以上の条件群の平均値を比較する分散分析になります。   このような3つ以上の条件群の平均値を比較する際に使われるのが分散分析です。   この記事では、1要因の分散分析について詳しく見ていきます。   な ...

こんにちは。産婦人科医のとみー（Twitter：@obgyntommy）といいます。   私は普段は画像系の機械学習の研究をさせて頂いてます。   研究の過程で教師なし学習で用いる"GAN"について学習したので、まとめました。   この記事の対象者は機械学習の初学者〜中級者の方です。   そのため、前線で活躍されている方には有益ではありません。   この記事では、まずはGANについて簡単に把握して頂き、次に実際にどの様な例で使用するのかということをGoog ...

こんにちは。産婦人科医のtommyです。（Twitter：@obgyntommy）   本記事では基本的なRのオブジェクトについて解説します。   対象としては全くRに触れたことのない方やRの学習初心者の方向けになります。   非常に簡単な四則演算の内容になりますが、RStudioを用意して実際に手を動かしてみてください。   RStudioを手軽にセットアップするにはRStudio Cloudが便利です。詳しい内容は以下を参照してください。   &nbs ...